Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms