Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pof1bQ8K4L4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms