Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms