Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms