Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr3Q8K296 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Mtmr3Q8K296 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr3Q8K296 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms