Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Fcho1Q8K285 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho1Q8K285 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho1Q8K285 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms