Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms