Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf3Q8K268 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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