Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh3Q8K1E6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh3Q8K1E6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms