Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms