Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ep400Q8CHI8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ep400Q8CHI8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ep400Q8CHI8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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