Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tshz3Q8CGV9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms