Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc43a2Q8CGA3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc43a2Q8CGA3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms