Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd4lQ8CFI0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd4lQ8CFI0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms