Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ercc8Q8CFD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms