Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riox2Q8CD15 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms