Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms