Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4aQ8C9S8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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