Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms