Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FarsaQ8C0C7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FarsaQ8C0C7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms