Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skor1Q8BX46 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skor1Q8BX46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor1Q8BX46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms