Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube3dQ8BX13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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