Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hirip3Q8BLH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hirip3Q8BLH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms