Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL66

Eea1, Early endosome antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eea1Q8BL66 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eea1Q8BL66 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eea1Q8BL66 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eea1Q8BL66 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms