Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfnl1Q8BHW9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfnl1Q8BHW9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms