Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra5Q8BHJ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms