Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms