Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdspl2Q8BG15 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdspl2Q8BG15 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms