Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms