Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfascQ810U3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms