Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Liat1Q810M6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Liat1Q810M6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms