Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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ChfrQ810L3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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ChfrQ810L3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChfrQ810L3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.3 ms