Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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