Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms