Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc28Q80XJ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms