Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actr5Q80US4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actr5Q80US4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms