Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpap1Q80TE0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpap1Q80TE0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpap1Q80TE0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms