Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc42bpbQ7TT50 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms