Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IfnkQ7TSL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms