Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms