Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnf1Q7TSH7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms