Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf250Q7TNU6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Znf250Q7TNU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf250Q7TNU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms