Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms