Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HhipQ7TN16 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HhipQ7TN16 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms