Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh1Q76I79 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms