Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rph3alQ768S4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Rph3alQ768S4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rph3alQ768S4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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