Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms