Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms