Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmnl3Q6ZPF4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmnl3Q6ZPF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms