Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asic3Q6X1Y6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms